Ovi antimikrobni peptidi izvorno su izvedeni iz obrambenih sustava insekata, sisavaca, vodozemaca itd. i uglavnom uključuju četiri kategorije:
1. cekropin je izvorno bio prisutan u imunološkoj limfi cecropiamotha, koji se uglavnom nalazi u drugim kukcima, a slični baktericidni peptidi također se nalaze u svinjskim crijevima.Tipično ih karakterizira jako alkalna N-terminalna regija nakon koje slijedi dugi hidrofobni fragment.
2. Antimikrobni peptidi Xenopus (magainin) potječu iz mišića i želuca žaba.Također je utvrđeno da je struktura antimikrobnih peptida xenopusa spiralna, posebno u hidrofobnim okruženjima.Konfiguracija ksenopusovih antipeptida u lipidnim slojevima proučavana je N-označenom NMR čvrstom fazom.Na temelju kemijskog pomaka acilaminske rezonancije, spirale ksenopusovih antipeptida bile su paralelne dvoslojne površine i mogle su konvergirati u kavez od 13 mm s periodičnom spiralnom strukturom od 30 mm.
3. defensin Obrambeni peptidi potječu iz humanih polikariotskih neutrofila zečjih polimakrofaga s kompletnim jezgrinim lobulom i crijevnim stanicama životinja.Skupina antimikrobnih peptida sličnih obrambenim peptidima sisavaca ekstrahirana je iz insekata, nazvanih "obrambeni peptidi insekata".Za razliku od obrambenih peptida sisavaca, obrambeni peptidi insekata aktivni su samo protiv Gram-pozitivnih bakterija.Čak i obrambeni peptidi od insekata sadrže šest Cys ostataka, ali metoda disulfidnog povezivanja je drugačija.Način vezanja intramolekularnog disulfidnog mosta antibakterijskih peptida ekstrahiranih iz Drosophile melanogasta bio je sličan onom obrambenih peptida biljaka.Pod kristalnim uvjetima, obrambeni peptidi su predstavljeni kao dimeri.
4. Tachyplesin se dobiva iz rakova potkovača, koji se nazivaju potkovači.Studije konfiguracije pokazuju da usvaja antiparalelnu konfiguraciju B-savijanja (3-8 položaja, 11-16 položaja), u kojojβ-kut su međusobno povezani (8-11 pozicija), a dvije disulfidne veze generiraju se između 7 i 12 pozicije, te između 3 i 16 pozicije.U ovoj se strukturi hidrofobna aminokiselina nalazi s jedne strane ravnine, a šest kationskih ostataka pojavljuje se na repu molekule, tako da je struktura također biofilna.
Iz toga slijedi da su gotovo svi antimikrobni peptidi kationske prirode, iako variraju u duljini i visini;Na visokom kraju, bilo u obliku alfa-spirale iliβ-preklopna, bitropna struktura je zajednička karakteristika.
Vrijeme objave: 20. travnja 2023